A primeira missão , a "Operação 40", ocorre em Cuba , em 1961. Seu objetivo final é o de assassinar o líder cubano, Fidel Castro, durante a invasão da Baía dos Porcos. Os jogadores que completaram com sucesso a missão ganhar um "sacrifício" ou "Morte aos ditadores " troféu. Outros objectivos incluem fugindo da polícia. Na próxima missão , " Vorkuta " você deve escapar de um campo de trabalho russo e proteger o personagem Reznov , um capitão do Exército Vermelho , que forma uma aliança com Alex Mason. Depois de escapar de Vorkuta , a terceira missão , " USDD " leva você para o Pentágono , onde você será direcionado pelo presidente John F. Kennedy para eliminar Dragovich , um general russo que é uma ameaça para a segurança nacional americana . A " ordem executiva " missão leva-o de volta para a União Soviética onde , como membro da CIA, o que você precisa para se infiltrar em uma base de lançamento de mísseis em Baikonur , destruir mísseis e matar Dragovich .
Missões 5-8
A quinta missão " SOG " ocorre no sul do Vietnã. Aqui você tem que salvar a agente da CIA Jason Hudson e defender a cidade de Khe Sanh contra os norte-vietnamitas . Você também tem que destruir todos os tanques. A missão intitulado " O Desertor " acontece durante a Ofensiva do Tet . Seu objetivo é rastrear um desertor , que acaba por ser Reznov . Você também precisa chegar a uma zona de aterragem , defendê-la e, em seguida, chegar a um barco. A próxima missão , " números", é definido em Kowloon , Hong Kong. Aqui você deve torturar , mas , em seguida, fugir com , prisioneiro Dr. Clark e agente da CIA Grigori Weaver. Você também deve escapar de um Spetsnaz , ou exército soviético, ataque. "Projeto Nova " a oitava missão , é um flashback de prisão de Reznov em Vorkuta . Como Reznov , você não assumir a missão , tanto quanto o jogo através dos acontecimentos da sua captura depois de uma batalha com o exército alemão.
Missões 9 a 12
A nona missão " Victor Charlie ", envolve escapar do Viet Cong depois de sobreviver a um acidente de helicóptero em território inimigo. No " Bater Site" missão , a ação se desloca para a fronteira do Vietnã com o Laos . Aqui você deve guiar um barco rio acima para encontrar um avião de carga Soviética caiu contendo lançadores de mísseis . Você deve destruir todos os inimigos e mantê-los longe do local do acidente. Em " WMD " você deve procurar por armas de destruição em massa na União Soviética e destruir as instalações onde são feitas antes de escapar com segurança. Para completar a 12 ª missão , "Payback " você deve escapar de captura pelo Viet Cong, destruir bases soviéticas e matar oficial russo Kravchenko .
Missões 13 a 15
No "Rebirth " missão , você deve procurar Friedrich Steiner, e enfrentar e matá-lo. Steiner é o inventor alemão de gás de nervos a Nova 6, que mata as pessoas em segundos. O próximo nível , " Revelations ", é semelhante à terceira missão . Tem lugar nas instalações da Agência de Segurança Nacional dos EUA , onde o jogador , como Alex Mason, é interrogado e descobre algumas revelações sobre o que ele está envolvido na medida . Na última missão , " Redenção" o objetivo é atacar o navio russo Rusalka e impedir Nova 6 de ser lançado sobre os Estados Unidos .